A alfabetização de crianças na educação intercultural não se baseia em métodos, mas sim na criança e no que ela representa para sua comunidade. O aluno não é passivo, mas aprende através da observação, diálogo, conversas, pesquisas e jogos, construindo seu próprio conhecimento. É importante que as crianças, orientadas por professores, desenvolvam atividades de co-pesquisa, colaborando com a alfabetização através dos conhecimentos indígenas e valorizando as línguas indígenas.