A partir de 1502, os europeus ocuparam a região, destacando-se a atuação dos padres jesuítas na catequização dos indígenas. A busca por ouro levou a expedições, como a de Francisco Chaves em 1526, em busca da trilha do Peabiru. A mineração se expandiu ao longo do Rio Ribeira de Iguape, aumentando a pressão sobre o território. A chegada de Martim Afonso de Souza em 1531 gerou conflitos com os europeus presentes, resultando na 'Guerra de Iguape' em 1536.